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生物安全柜分為三級：一級生物安全柜、二級生物安全柜、三級生物安全柜。生物安全柜廣泛應用于醫療衛生、疾病預防控制、食品衛生、生物制藥、環境監測以及各種生物實驗室。是保障生物安全和環境安全的重要基礎，屬于“民生"計量范疇。
一級生物安全柜
一級生物安全柜是市場上看到的設計簡單的最基本的生物安全柜類型。微生物運行過程中產生的氣溶膠與外界空氣混合進入安全柜，灰塵顆粒或傳染源經過濾系統過濾，最后將潔凈無污染的氣體排放到外界環境中。過濾系統通常包含一個預過濾器和一個 HEPA（高效空氣過濾）過濾器。
一級安全生物柜雖然可以保證操作人員和環境不受傷害，但不能保證實驗中使用的樣品不會受到實驗室空氣的污染。當然，不能*排除交叉感染的可能。因此，一級生物柜的使用范圍極為有限，此類生物安全柜已落后于現代生物安全等級的防護需求。
所有一級生物安全柜均可用于達到生物安全一級、二級、三級的微生物因子運行。生物安全柜用于在處理原代培養物、菌株、診斷標本等傳染性實驗材料時保護操作者、實驗室環境和實驗材料，避免暴露于上述操作過程中傳染性氣溶膠和飛濺物。
二級生物安全柜
與同一生物安全柜一樣，氣體從外部流入二級生物安全柜，通常稱為流入。流入可防止微生物操作過程中產生的氣溶膠從安全柜前的操作窗逃逸到實驗室內。然而，它們與 1 類生物安全柜的不同之處在于它們只允許經過 HEPA 過濾（無菌）的空氣流過工作表面。內置風扇通過前開口將空氣引入安全柜并進入前進氣格柵。因此，未經過濾器過濾的空氣不會直接進入工作區域，從而保護存放在安全柜內的樣品和儀器不受外界空氣的污染。
二級生物安全柜的*之處在于它是通過垂直分層的片狀（無方向性）HEPA過濾器（功能：過濾雜質等）進行過濾，然后在安全柜內部形成向下流動的氣流.氣流的持續充能可產生空氣傳播感染在安全柜內，避免柜內樣品被感染。這種氣流稱為下沉氣流。
不同類型的二級生物安全柜的主要區別在于：廢氣比例和通過高壓空氣再循環的氣體比例不同。另外，不同的二級生物安全柜有不同的排氣方式：有的安全柜將空氣直接過濾到室內。
有些通過連接到專用通風管道的套管或通過建筑物的排氣系統排放到建筑物外部。
除上述區別外，所有二級生物安全柜都與一級生物安全柜相同，可以保護操作人員和實驗室環境免受傷害。此外，二級安全柜還可以保護產品樣品在微生物操作過程中免受感染。
二級生物安全柜可用于一級、二級、三級生物安全等級的生物因子運行。三級生物安全柜
三級生物安全柜提供了一級和二級安全柜無法提供的最大安全保障。生物安全柜廣泛應用于醫療衛生、疾病預防控制、食品衛生、生物制藥、環境監測以及各種生物實驗室。是保障生物安全和環境安全的重要基礎，屬于“民生"計量范疇。三級生物安全柜均采用金屬焊接結構，采用全密閉設計。實驗操作*通過前窗的手套進行。在日常操作過程中，安全柜內部始終保持負壓。即使在物理防污染系統出現故障的情況下，它也可以提供安全性。
所有三級生物安全柜都有經過HEPA過濾器過濾的清潔空氣，以提供產品保護并防止樣品交叉污染。廢氣通常通過 HEPA 過濾。或者并排使用兩個 HEPA 過濾器。實驗所需物品通過安放在安全柜側面的隔離通道送入柜內。三級安全柜通常將廢氣直接排放到實驗室。但是，空氣也可以通過外部排氣管直接排放到外界環境中。使用排氣管路系統時，三級安全柜也適用于試驗時需要添加有毒化學品的微生物操作控制。
三級生物安全柜均可用于涉及一級、二級、三級、四級生物安全的微生物因子實驗。特別適用于產生致死因子的生物試驗。
